Bu programdan mezun olan uzman fizyoterapistler sağlık profesyonelleri olarak çalışabilir ve isterlerse kariyerlerini daha üst düzeyde doktora ve sonrasında akademik çalışmalarla ilerletebilirler.
Programa kayıt yaptıran fizyoterapistler; hastanelerde, tıp merkezlerinde, özel eğitim ve rehabilitasyon merkezlerinde, spor kulüplerinde, huzurevlerinde, sağlık yaşam merkezlerinde vb. çalışabileceği gibi aynı zamanda hem devlet hem de vakıf üniversitelerinde araştırma görevlisi kadrolarına başvuru hakkına sahip olacaklardır. Programdan mezun olduktan sonra “Uzman Fizyoterapist” olarak öğretim görevlisi kadrolarına başvuru hakkına da sahip olacaklardır.
Başka üniversitelerde Fizyoterapi ve Rehabilitasyon Tezli Yüksek Lisans programına kayıtlı öğrenciler yatay geçiş ile programa kayıt yaptırabilirler.
Yüksek lisans programına dikey geçiş uygulaması bulunmamaktadır.